2型糖尿病患者較1型糖尿病的脂蛋白在數量及質量上的異常更為顯著，最主要表現為血清vldl升高。根據美國資料顯示，2型糖尿病伴有高三酰甘油血症的發生率高於40%。導致2型糖尿病患者高脂血症的主要原因是由於胰島素不足，胰島素抵抗等所致的vldl、三酰甘油的產生過多和清除缺陷。對於輕至中度血糖升高，且不接受胰島素或口服降血糖藥治療患者其高三酰甘油血症主要是由於vldl分泌增加引起，盡管同時存在vldl分解障礙(即使脂蛋白脂酶活性正常)。然而，在較嚴重的高血糖未治療的2型糖尿病患者中，脂蛋白脂酶活性減低，這些患者由於胰島素抵抗使胰島素相對缺乏較嚴重。但是可能同時發生vldl產生過多，經數周至數月應用胰島素或口服降血糖藥治療，脂蛋白脂酶活性得以糾正，同時血漿三酰甘油水平亦轉為正常。肥胖可加劇2型糖尿病患者的胰島素抵抗，加重高脂血症。另外，apoe的多型性改變也影響了2型糖尿病患者的血脂變化。攜帶ε2基因的2型糖尿病患者並發高脂血症的頻率高達73% ，呈現血清三酰甘油、vldl一膽固醇，vldl-三酰甘油水平的明顯增高。
2型糖尿病患者ldl代謝也發生紊亂，輕度未治療的2型糖尿病患者，ldl合成和清除同時增加，導致ldl膽固醇正常。未經治療或控制較差的中度高血糖患者，ldl分解代謝障礙，導致ldl輕度增高。另外，伴有胰島素抵抗的患者，ldl的體積大小及密度的排列亦發生變化，表現為b亞型的增加，因這種b亞型含有較小而致密的ldl顆粒，且含三酰甘油的比例也增高，故有致動脈硬化的危險。
2型糖尿病時，hdl膽固醇常降低，隨體重減輕和胰島素或口服降血糖藥治療而hdl增加。與1型糖尿病相似，其可能部分是由於hdl核心中的膽固醇被三酰甘油替代所致。在治療過程中，由於該過程的逆轉，因此在三酰甘油減低時，使hdl也增加。治療時hdl也可因vldl分解障礙而增加。